55 лет назад - 26 февраля 1969г., - при городском Доме пионеров города Волгодонска был создан народный музей .

В январе 1977 года народный Волгодонский городской краеведческий музей преобразован в филиал Ростовского областного музея краеведения.

Постановлением №422 от 23 октября 1993 года  Главы Администрации Ростовской  области «О преобразовании филиалов государственных музеев области в самостоятельные музеи»  Волгодонскому городскому краеведческому музею присвоен статус самостоятельного музея. 

Постановлением №370 от 30.07. 2003 года Администрации Ростовской области государственное учреждение культуры Волгодонский городской краеведческий музей переименован  в Государственное областное учреждение культуры «Волгодонский  эколого-исторический музей».