В Таганроге царь вел размеренную, без всякого придворного этикета жизнь. Одевался в простой военный мундир, ходил с императрицей на базар, где удивлялся дешевизне продуктов. Осенью, поддавшись настойчивому приглашению новороссийского генерал-губернатора Воронцова, государь отправился в Крым, откуда вскоре вернулся больным, но лекарства принимать отказывался. Занимался делами. Между тем болезнь прогрессировала. 14 ноября государь встал в седьмом часу и приказал подать себе бриться, но от слабости рука дрожала, и он, порезав щеку, упал в обморок. С этих пор Александр I уже не поднимался. Его перенесли в кабинет и уложили на большой диван. Царица сама попросила супруга причаститься. Под вечер с трудом отыскали соборного протоиерея отца Алексея Федотова, напившегося вдребезги на купеческой свадьбе. Опрокинули ему на голову ушат ледяной воды и доставили во дворец. Узнав, чью исповедь предстоит принять, он вмиг протрезвел.

 18 ноября 1825 г., ближе к полуночи, у больного началась агония. А на следующий день царь скончался. Был собран чрезвычайный комитет, в который вошли: Волконский, Чернышев, Логинов, Вилье, протоиерей Федотов, хирург Тарасов. Ими был составлен акт: "Император Александр I 19 ноября 1825 года в 10 часов 47 минут утра в городе Таганроге скончался от горячки с воспалением мозга". Версия отравления, витавшая в первые дни болезни, была отвергнута.

Бальзамировали труп с огромным трудом - в провинциальном Таганроге не нашлось ни нужного количества трав, ни препаратов, ни даже спирта. Для свинцового гроба градоначальник велел содрать свинцовую крышу с ближайшего дома.

Императрица после смерти царя выехала в дом Шахматова, откуда посещала панихиды. Из Черкасска (тогдашней столицы донского казачества) были выписаны четыре генерала и шесть полковников, использованных в качестве часовых. Тело сначала было положено в кабинете, где священники по очереди читали Евангелие. Во время посещения царицы все покидали комнату. Вынос тела императора в церковь греческого Иерусалимского монастыря состоялся 11 декабря, а 29 декабря печальное шествие направилось в Петербург.

После смерти Александра I вдова прожила в Таганроге до 22 апреля 1826 г., хотя придворные торопили ее покинуть город, потому что скучали вдали от столицы. Оставляя Таганрог, императрица сделала щедрые пожертвования. Елизавета Алексеевна не на много пережила своего супруга - она умерла 4 мая 1826 г. по пути из Таганрога в Петербург на 45-м году жизни.